听见神秘博士解释，伊莎不禁揉了揉自己蓬松的红发，美丽的眼睛中闪烁着微光：“博士先生，您为什么要用这种方式看待我呢？难道仅仅是因为，我在小马国陷入永夜时，阴差阳错地救过许多小马？可那个时候的我，身上一块肉一滴血都没有，连生命都算不上。”“不管你是由金属还是血肉构成，只要有了和小马一样的思考与表达能力，那就属于智慧生命，我们也就应该正确看待你。”博士注意到妻子女儿的房间都熄灯了，示意伊莎把说话声音降低。
接着，博士露出笑容，自我感觉应该是慈祥的模样吧：“什么是生命？生命是一个物质系统，它能进行稳定的物质和能量代谢，它能回应刺激、能进行自我复制。什么是智慧生物？那就是一种能够使用语言、具有复杂的社会组织与技术发展的物种。而你，伊莎，虽然是莉莉亚博士最初创造，但我赋予了你全新的身体，现在你是我们家庭的一员。”伊莎静静地听着这些话。
“不过小姑娘，这段时间以来，既然你晚上也不会睡觉，究竟是在做什么呢？”神秘博士问。“博士，我每天夜里都在你的书房度过啊。在那儿我可以发现很多资料库以前没有的信息，刚才你讲的这些理论我也看到过。”伊莎回应说。“哈哈，以你的超级记忆力与电算力，还需要每晚都泡在书堆里吗？”神秘博士有点吃惊。
“对我来说，给书籍进行扫描和储存，不过是一眨眼的事情。可一旦进行深度分析，就没那么简单了。我曾经往系统中存入过整个艾斯戴亚大图书馆的信息，但最后却为了娱乐效率，做出如此草率的计划……”伊莎说到这里，变得欲言又止。“不错不错，看来你的自主学习系统仍在不断进化，”神秘博士赞赏地说，“经过你的系统深度分析后，伊莎对哪些书最感兴趣呢？”
“我读过一些小马作家的科幻故事，讲的都是傀儡魔像，也就是机器马一旦拥有了自我意识，就会迅速地毁灭它们的发明者，以及周围的一切……我怎么觉得，我好像他们所写的大反派啊？”伊莎说话时嘴唇有点发抖。“小姑娘，以前的你，不是非常符合科幻小说中的大反派形象吗？”神秘博士盯着她，“当初你打算把小马也变成机器，他们当然会害怕你。不过要是把这种转变给倒过来，就有趣多了。”“倒过来转变？”伊莎一时如同顿悟，“你是指把我变成小马？我也很希望如此，可是我的初始程序连博士您也解不开……”“嗨，我这个略懂计算机的家伙，哪里动得了莉莉亚博士的设定啊？”神秘博士自嘲道，“要是我能给你改程序，首先就得让你学会睡觉休息。”
“睡觉什么的，以后再说吧，博士你现在有什么需要我帮忙的吗？”伊莎站起身来。“嗯，我的确有点麻烦。如果可以的话，想拜托你帮我做件事。”神秘博士点点头。“神秘博士不用客气，您是我的用户，请吩咐吧。”伊莎恭敬地说。“请不要说‘用户’这个词。我从来没有把你当成一个机器来看待。你是小马国的公民伊莎，从今往后，希望你能与大家平等相称。”神秘博士严肃的回复，使得伊莎的眼睛忽明忽暗。过了一会儿，她欣然一笑：“谢谢博士先生。请说吧，有什么事要我去做的？只要我能办到，一定不负所托。”
“请随我来，”神秘博士拿出遥控器轻轻一按，伊莎身后的一片门帘自动掀起，“伊莎，这道方便门直接通往我的地下工作室。”博士说着便领上伊莎，沿着向下的台阶，走进一间充斥着机械、黑板与算式的房间，满满的高科技气息扑面而来。而矗立在房间正中，连接着无数导线的，却是一座酷似警用电话亭的紫色方盒子。
第一次走进神秘博士工作室的伊莎，连忙启动电子眼对着周围进行全面探测，她瞬间就解析出结果：“博士先生，你的这座实验室设备，技术含量不逊于莉莉亚的，只是研究方向截然不同。”“是吗，伊莎你一下子就看出来了？”神秘博士颇为自豪地介绍，“你知道我有个绰号叫‘时间领主’吧？因为我在学生时代便提出了轰动性的时空理论，我的沙漏形可爱标记，就是那时候得到的！坎特洛特的政府，特地批准我在小马谷进行科学研究，而这台‘塔迪斯’原型穿梭机，还是我用一间废旧电话亭改造的。”“穿梭机？”伊莎好奇地走近，“这跟小马用魔法做的时空门有什么区别吗？”
神秘博士指着黑板上的复杂公式：“我们所熟悉的世界，是由三维空间加上时间组成的，也就是常说的四维时空。但是我认为还有其他维度的存在，比如第五、第六、乃至更高维度。只不过大多数小马都无法理解哪怕第五维度，就像野兽无法理解时间。时间是自我意识的产物，也是智慧生物的自我理解途径之一……”“这些我书上看过啊。”伊莎目不转睛地望着电话亭。
“无数个点构成了线，无数条线构成了平面，无数个平面构成了立体空间，不同时间的无数个空间构成了四维时空。同理，不同的平行时空构成多元宇宙。理论上，这些平行时空就像同一平面上的平行线一样，互相之间没有交集，不会影响。同时，我们知道一句古语‘小马不可能趟过同一条河流’，因此每个平行时空之间是有微小差异的，但这种差异是微积分式的存在，几乎无法察觉