甚至苏联空军自己也意识到了这种模式的巨大弊端，并在41年4月开始改革，只是时间太晚，导致开战时，新的后勤单位只完成了不足15（54个中的8个），而这些实际建立起来的新后勤单位所需要的装备则更是只到位了不足30
三是，老生常谈的指挥系统硬件与软件问题，苏联空军被多方指挥仅仅是宏观问题。在微观上，缺乏无线电装备使得苏联空军在面对全套无线电武装的德国空军时，就像一支一战武装。
而更糟糕的是原本可以通过自身经验与能力弥补这些问题的，实际掌控苏联空军巨大力量的指挥员的水平，比所有其他军种都要糟糕。
超过91的航空兵团指挥员在岗时间不超过6个月，而这数据扩大到整个空军指挥系统，又有65的指挥员任职不满一年，43的任职不满半年。而在这些缺乏实际岗位经验的指挥员中，还有大量是从飞行学校提前毕业的。
四是，战术水平问题，苏联空军不仅仅缺乏为部队提供战术战役侦察的能力，甚至连其本身最为重视的歼击机战术也落后于他们的对手。
在德军已经使用现代空军的灵活的双机或四机编队时，苏联空军还在使用密集且笨重的三机编队，同时还严重缺乏于陆军的配合。
这一点在西南方面军早期反击中最为突出，作为提前采取措施，使得德国空军第一波对地打击全部扑空的方面军。
几乎保存了全部空军实力的方面军司令部，却没能将空军和陆军的反击协同起来，导致当陆军冒着德军的轰炸前进时，空军却在毫无必要的地方流血。
而相比德军拥有优势的轰炸机部队的表现更是离谱，只会使用楔型或横队密集队形飞行，并且只在一个固定高度投弹，甚至不会根据德军防空力量情况，调整轰炸路线。
（只在固定高度僵硬的沿直线轰炸，甚至被作为挨炸对象的德军步兵在回忆录中鄙视，简直离谱。
对于这些德军步兵来说，相比成规模的有德国空军去拦截的轰炸机编队轰炸，他们更怕的反而是单机出动，德国空军管不过来的，苏军老旧轰炸机的随机扫射与轰炸。）