发现整栋楼都开始陷落。
美里命令俩人退了回来。
随后往外想要拉回机体，如果碇真嗣不操控初号机，就会丢掉生命。
明日香开始嘲讽顶针是火塔不过是测试第一名就开始说。
绫波丽来到明日香面前，她问明日香是不是为了别人的称赞CIA会驾驶EVA。
明日香说是为了自已。
时间已经过去12个小时，碇真嗣驾驶着初号机眼前一片雪白。
赤木告诉打击，地面的阴影是一个纳米空间内部是AT立场，那才是本体。
只有本体被消灭才开始。
此时和EVA一起在使徒体内的碇真嗣发现净化能力开始降低开始出现不妙。
顶针不知道该怎么办。
赤木提出强制就出机会就是将现在的地雷全部投放到中心位置。
然后利用其它的俩太EVA的AT立场，干扰使徒的虚数回路七分之一秒之后在一瞬间将骑爆破。
赤木提到应该以回收EVA为关键，不应该管驾驶员。
赤木斥责美里，他们如此看重初号机的理由是什么，EVA又到底是什么。
赤木让美里相信自已，并且全权负责这次作战。
此时虚数空间的碇真嗣看到了另外一个自已。
另外一个碇真嗣是他的另一面。
这个时候一道光芒闪光，大家看到在球体中出现一个手，初号机从里面走出来。
碇真嗣行了过来他告诉美里只是自已想再见到自已。
第二支部和四号机都不见了，为连发只意外在发生，决定将三号机送到D市。
碇真嗣开始了傀儡机的使用，茨木打算从候补人员中选择第四个。
在休息区，美里告诉阿亮，所谓机关补充子啊，只是在挑选EVA驾驶员然后让美里去调查。
阿亮带着碇真嗣来到了自已终止西瓜的瓜田。
他说自已的爱好存在，看着生物生长有一种美好的感觉。
他告诉碇真嗣知道痛苦的人可以温柔代入。
原来第4任是碇真嗣的同学阿东。
阿东知道自已即将驾驶EVA的消息并没有太多欣喜。
他提出的调价你是将妹妹转移过去。
碇真嗣听说三号机的事情。
三号机的启动顶在宋代，他询问驾驶员是谁。
启动试验一切顺利，美里打算之后告诉。
但是突然三号机出现搞能量反应但是号无效对哦。
茨木意思到是死徒入侵，试验场发生率爆破，EVA全员感到现场，直接进行指挥。
碇真嗣决定放弃三号机标记为十三死徒。
紧跟着三号机攻击了好几又朝着初号机过去。
绫波丽她清楚知道三号机驾驶员是阿东有些犹豫。
三号机发现令他并且时间来到零号机的身后。
父亲下令切断了手臂，零号伤害和那严重。
此时只剩下初号机可以战斗。
碇真嗣操控者初号机，他想到还有和自已的同龄的孩子啊坐在上线此次外发下手。
终于三号机走了过来，一把掐住了初号机的脖子将他按到山上。
但是碇真嗣还是没有反击。
服气你告诉他，上面坐的是敌人，不反击就会死亡。
碇真嗣说那也比杀人好。
碇真嗣下令切断链接竟回路切换为傀儡系统，碇真嗣陷入了黑暗之中。
傀儡系统开始操控傀儡系统，一拳就击败了这个。
初号机完全不同顶针的操作，直接逆隋了这个。
三号机完全消灭，美里得知三号机被出号当成使徒处理掉了。
不知道该如何面对碇真嗣，碇真嗣却听到三号机驾驶员升还。
他终于发现了阿东是驾驶者。
碇真嗣无法接受这个事实拒绝从EVA出来。
他觉得NERV在利用自已并且微笑要进攻。
父亲说自已没有时间听儿子撒娇。
强制拉出了碇真嗣。
在睁开眼睛的时候看到班上。
班长告诉阿东他有几个泥水了三天。
只是阿东没有发现自已左腿没有了。
父亲告诉碇真嗣，自已对他很失望。
随后碇真嗣告别美里准备离开。
碇真嗣下令绫波丽驾驶，。二号机出现杂地面但是攻击无效，使徒切开了这个。
阿亮询问他为什么来。
阿亮说一旦使徒和地下解除。
而自已被开除了，但是碇真嗣可以驾驶初号机这就人类。
绫波丽拿着炸弹开始自爆攻击，但是没有伤害到使徒反而零号机失去了战斗能力。
阿亮让碇真嗣自已考虑这些，碇真嗣看着到底的同伴跑回了据点。
父亲问他为什么回来
他向父亲喊道自已是EVA的驾驶员。
此时使徒来到地下据点完全暴露，初号机及时出现双方斗的难分难解。
使徒切断了初号机的手臂随后和出号一起回到了地面。
发狂的碇真嗣要消灭使徒时候的点亮不足，使徒马上夺回了主动权。
没