有电力的初号机一下一下承受着使徒的攻击丝毫不听从碇真嗣的控制。
突然完全断电的初号机睁开眼睛，进入了暴走状态。
初号机最终暴走。
父亲说一切才刚哪款爱上。
战斗过后二号机和零号机都受到了重创，要很长时间回复。
超级计算机建议大家一起转移到过去的据点。
此时初号机停止了行动，碇真嗣还在初号机里面排除新号被拒绝。
这个时候场来了内部影响，里面居然是空的。
赤木说碇真嗣被吞噬了，她说EVA不是单纯的复制品其中有着人类的十香。
美里让赤木想办法拯救碇真嗣。
赤木告诉美里碇真嗣失去自我意识，以量子状态漂流在里面。
变成了肉眼无法砍价你的昨天，而这里也将变成这个其中包括灵魂。
鹰就机会变成促成了**字啊恒。
赤木拿出几乎书，这是十年前的原件。原来EVA制造都是会后就有这样的事情。
鹰就计划开始，但是很快就失败。
紧跟着门打开，碇真嗣的作战服有了，美过去抱着作战服哭了起来。
父亲在担心碇真嗣是否还可以活下去。
母亲说只要活下去就可获得幸福。
据点的冬月被绑架了，阿亮被认为是主谋。
由于阿亮和美里的特殊关系，情报科找到了美里带走了她。
东月被带到另外一个势力那里，老人们以为石碑形式和他见面。
黑暗中，冬月听到有了喊他老师于是回忆起以前发生的的事情。
当年冬月是一名教授，当时他所在的学校有一个名字叫阿维的学生。
要毕业了冬月询问阿维以后的算是就职还是继续做研究。
阿维说若果有合适的人，自已会考虑但一名家庭主妇。
而后东月受委托保释了一个名字叫阿渡的人。
冬月似乎不是很喜欢他，但是没想到他居然是阿维的男友。
东月觉得阿渡的目的不承担，也许就是为了接近背后的势力。
第二次冲击后，冬月又一次见到阿渡，他告诉冬月自已和阿外户结婚了。
美里面被囚禁起来，冬月响起当年第二冲击是陨落石冲击导致的。
但是真相不是这样，但是他开始调查问起了阿渡这件事情，来到地下看到了新世界。
但是看到茨木的母亲，参观了EVA的存在。
之后阿渡邀请冬月加入自已的研究。
茨木回忆起了自已大学的时候和美里在一起的时光。
那个时候美里经常翘课，原来美里在和男朋友校外同居，男朋友就是阿亮。
小时候的碇真嗣被母亲带到基地。冬月说孩子不应该来这里。
母亲说应该让孩子看一看光明的未来。
没想到这是母亲在世的最后一句话
在随后，发生率意外，母亲离开了这个世界。
母亲去世以后，阿渡发起了补完计划。
而一只喜欢阿渡的直子博士似乎找到了机会。
长大以后的赤木，加入了据点成为E计划的参加者。
阿渡将绫波丽带到了禁断in。
一只和阿渡有暧昧关系发现凌波和阿外很想。
超级计算机研究成功，赤木告诉母清美里也加入了据点。
而阿亮分到了别的地方俩人分手了。：，，，